По первой. Не факт что промывка поможет. Очень похоже что кто-то из соседей сделал выгребную яму наплевав на все СНИПы (отсутствует бетонное дно) и говно просачивается в водоносный горизонт. Поспрашивайте у соседей, есть-ли у кого подобные проблемы, если есть, 100% выгребная.
По второй. Сколько эксплуатируется скважина? Настоятельная рекомендация сменить насос на более мощный. Если мне не изменяет память, "малыш" выдает около 0,8 куба в час, смените его на погружной насос с подачей не менее 3-х кубов в час, и покачайте без остановки несколько часов подряд. Должны произойти изменения в цветности воды. чем больше выкачиваешь воды из скважины, тем лучше. Далее уже смотреть по ситуации.
И еще вопрос, скважины находятся на одном участке? Насколько далеко друг от друга? Зимой пользуетесь или герметизируете на зиму?